雨花石的石质为天然玛瑙，主产于南京及其周边一带，有白、绿、黄、红等颜色，晶莹细腻，通透可爱，早在明代，就有人赏玩。李时珍在《本草纲目》中云：“金陵雨花台小马脑，止可充玩耳。”不过，明代中前期是以赏玩太湖石、英石等用于装饰亭园的大型奇石为主，雨花石尚属于不入品流的文人清玩，还没有太大的经济价值。

      明末时期，雨花石开始受到藏家的重视，有人开始以高价求购。由于有了市场，需求量大增，产地的农民，遂改成以采石为业，每逢大雨过后，山间的小溪小涧涨水，就会出现许多采石者，甚至还由此而形成了一整套的产业链条。交易市场的活跃繁荣，导致雨花石的价格水涨船高，一粒小石子，一度卖到了一两银子以上。

　　集藏雨花石的第二次热潮从清代中期开始。由于有乾隆皇帝的亲自参与，民间的收藏风气也日盛，图纹造型精美的雨花石，价格亦颇昂贵。

　　这一时期，南京有个姓江的教书先生，捡得一块雨花石，石上的图案为一轮冉冉升起的红日，在朝阳的照射之下，两只雄鸡很威武地站在下方。鸡的羽毛和脚爪，以及头顶上的肉冠，都非常鲜明突出。由于石头晶莹剔透，澄澈明亮，红日也被映衬得更为艳丽秀美，望之逼真。后来有人出价八两银子购走。

　　最具传奇色彩的雨花石交易，是清末的一个浙江商人，某天在市场上看到一块如同鹅蛋大小的圆石，光滑晶莹，就以几十文钱的低廉价格买回了家，写字时作为镇纸使用。某天，有个西洋客商到他家里作客，见了这块圆石，问商人是否肯卖。商人虽然不识货，但看到西洋客商不忍释手的样子，猜想这块石头必定是个值钱的东西，表示有好价钱才行，索价一百银元，没承想，对方当即一口应承。西洋客商怕他反悔，还请了几个人作为中保，又签署下买卖协议，然后打来一盆清水，把石头放到水中。石头一入水，顿然变得通澈透明，石头中间还隐隐显现出一匹小马的图案，非常逼真，把旁观的众人都看呆了。而这块以一百银元成交、被称之为“马精石”的石头就是雨花石。西洋客商见多识广，又知道鉴赏方法，所以肯花大价钱买下这块雨花石中的精绝妙品。

　　雨花石在上个世纪经历了一个漫长的低潮时期。上世纪六七十年代，香港的国货公司售卖雨花石，以磅论价，每磅9元港币，而香港人都觉得贵。到了上世纪九十年代，精品雨花石在本埠的交易市场，售价也不超过百元一枚。而如今，雨花石的价格也是随着收藏热的升温而不断上升，成为石中奇葩。